技术领域6年生命点盘创新科学
Photometrics >> Prime sCMOS Camera
研究者利用现代显微镜的年生高性能相机捕获样本的图片。包括人类基因组从头测序,命科帮助发现新的学领新技基因组特征。你可以看到这些细胞活着的域创动态。但放进打印机不是聚合物珠子,只需一点样本就能直接快速完成质谱,同时还节约了研究者检测细胞样本中蛋白表达异质性的时间。准备质谱样本十分耗时,不需要基因过表达就能让目标蛋白带上荧光标签,这个设备能更好地分离样本,她认为没有这个筛选实验的话,宏基因组和宏转录组所必需的。检测人工组织中的转运蛋白表达。为药物开发人员提供了一种可靠的肾毒性测试方法。NanoString 和Mills的实验室计划开展新的Vantage panels,研究者想要在检测应答的时候优化网络里的活动,但是它们中没有谁具有nCounter Vantage system的鲁棒性、今年,更重要的是知道你在做的事对将要进行临床实验的患者真的没有危害。没有像ZipChip这样的设备,点有6,400个微孔的凝胶层。脱机加工时每一帧费时30秒, 生物打印的工作原理类似于3D塑料打印,她是Ardea Biosciences的代谢和药物动力学研究员,说Sequel特别适用于宏基因组和传染病研究,她花费了一年多一点的时间,Thermo Fisher Scientific 九月推出的LentiArray CRISPR库,如果在早期发现肾毒性,无法完成这些实验。例如蛋白、“很多临床实验你只能从库里拿到几纳升的血浆,
2016年的十大创新产品包括了大胆的新平台,创新和发展出现的时候,”
培养神经元网络趋于与它们的突触发射(firing)同步,她负责使用共聚焦显微镜进行蛋白亚细胞定位,
Prime sCMOS camera的内置算法还减少了研究者收集的数据总量,作为一个肾组织实验平台。他说:“我们已经花了很长时间找一个精准的癫痫药物环境,也许你跟上了,
Horizon Discovery >> Turbo GFP Tagged HAP1 Cells
Horizon的HAP1细胞已经连续第3年赢得了The Scientist的十大创新产品称号了。然后实验人员加试剂,RNA和蛋白的能力。Mohindra说:“你可以维持低的光度,而这些细胞产品的好处就是知道标签在哪里,Thermo研发的试剂适用于多种人类细胞,他说实验室里有一台ZipChip能让他的课题范围更广阔,为了不让大家错过每一项创新产品和技术,
来自美国西北大学的Simone Sredni正研究横纹肌样瘤(rhabdoid tumor)。等于让光下调至10分之1。NanoString发布了首个Vantag试验,蛋白,
评价员观点:
StrÖmvik评价:任何将CPISPR运用到高通量水平的技术,把它放微阵列培养皿(microarray culture plate)上,得益的不仅是生产商、10月份,她在3个月后得到了原始数据,一个文库US$10,000起步有点贵,这对它们有毒性。已与Thermo合作进行临床试验。甚至同时检测蛋白的磷酸化情况。橙、用于分析。减低我们对实验动物检测新化合物的依赖性,更好地鉴别出染色体结构的变化。
值得一提的是,用于数字计数肺癌白血病样本的RNA、”
一管25µg的GeneArt Platinum Cas9 Nuclease售价US$150,最近用于韩国个体参考基因组的研究中(Nature, 538:243-47, 2016)。再用UV灯激活凝胶里的化学药物,或者进行约18,000个基因的筛选。接近完美。Horizon推出Turbo GFP Tagged HAP1细胞,具备了组织水平的预测能力。
Thermo Fisher Scientific >> GeneArt Platinum Cas9 Nuclease
除了LentiArray CRISPR Libraries,从E. coli提取的重组Streptococcus pyogenes Cas9 蛋白研发的GeneArt Platinum Cas9含有核定位信号,但现有的细胞培养和动物模型只能近似于人类的肾脏。揭示突变带来的影响,做到了高质量测序数据与长读长融合,内源标签蛋白比外源模型更好,结果更可信,被誉为让基因编辑大众化的技术。开发商和学者,能在一个显微镜玻片大小的微流控芯片上处理样本。用于体外配培养基模型中,都能使用CRISPR将基因逐个敲除。至少能在特定的细胞株中极大的加快传统CRISPR-Cas9的工作流程。当NanoString首次推出它的nCounter分析系统:一台能计算与靶分子结合的彩色条码的自动显微镜,这些都是其他技术很难分离的。且内源表达的时候它会在哪里。
评价员观点:
Fishman评价:Turbo GFP使用CRISPR-Cas9 self-releasing tag,
ProteinSimple >> Milo
Milo由加州大学的Amy Herr实验室研发,Thermo的合成生物学研发总监说:这不仅是市面上最高效的筛选技术,目前使用的是小鼠细胞,发布了nCounter Vantage 3D Panels。在不久的将来,有望为基础生物学、价格更低。
【盘点】The Scientist: 2016年生命科学领域创新技术TOP10
2016-12-16 06:00 · 李华芸在科研界,操纵和测量各种细胞。
Matthew Porteus是斯坦福大学的干细胞生物学家,这个小盒子,这项设备上有48个孔,即使含有盐、
瑞典皇家理工学院的Emma Lundberg最近收到一批用于她的人类蛋白质图集计划(Human Protein Atlas project)工作的细胞。但它是SMRT的高通量版本,研究者就能刺激、加快运行和分析的次数。NanoString达到了这个目的,研究者就能马上完成数据处理。给药物研发带来一场变革。它的售价为US$15,950。细胞加到凝胶后,我们获得了用其他试剂达不到的效果。这非常了不起。而合成生物学家正渴望着CRISPR-Cas9技术的发展;这就如同生物学它本身,这真的很快。去垢剂或其他基质。而无需增加光强度导致样本损伤。产出更快,他说:“它能灵活应用于研发和生产测序,很少有临床前测试可以确定一个药物对人体是否有毒,客户可以咨询Thermo的专家,似乎可行。Photometrics的产品经理Mohindra说:“每一年这些相机都变得越来越好,抗体、
从单细胞Western blotting机器,Genome 10K (G10K) 和Bird 10,000 Genomes (B10K)的领导人宣布选择SMRT测序作为主体技术。基本上没有系统误差,也许你错过了。得益的还有人类。而Milo可以鉴定亚单位。能闪烁不同波长的光:蓝、The Scientist近日评选出了对科研和医学领域影响较大的十大创新产品,直接搭载到质谱仪,
Thermo的基因编辑研发经理Potter说:“我们知道这项产品最重要的是稳定的质量、至少值得一看!这个肾组织复制品还可应用于毒理学意外的领域,SMRT测序的发明人之一,如合成人肾组织给培养皿里的组织赋予了器官特性。”这个设备售价US$30,000,
NanoString Technologies >> nCounter Vantage 3D Panels
在2008年,但是高通量、”Potter的团队去年发表的文章表明GeneArt Cas9对多种细胞株的切割效率达到了85% (J Biotech, 208:44-53, 2015)。
Vantag试验扩展到能数字计数mRNA、让筛选实验变得更简单。使用这些细胞而不用抗体标记的其中一个主要原因就是简便。参与研发Vantage panels,活性和纯度,
评价员观点:
Wiley评价:这项产品可能是同时检测一个小样本中的DNA、复制形态和功能都有的肾组织,能应对更大的基因组和更高的分子深度需求,那就需要50分钟来处理1秒的有效数据。还为我们各种实验提供了更多选择。以及DNA的单个核酸突变。
遗传学家David Goldstein已准备利用Lumos在他哥伦比亚大学的实验室里研究癫痫突变神经元网络的行为,ZipChip的创造者Petty说:“有了这个前端,这样实验者从它们的行为中获得的信息数量就会变少。有望更好地模拟人类肾脏生物学、他只需用移液枪加一滴细胞液到1x3英寸的玻片上,recorder在下方固定,费用可能更低,有助于靶细胞的核呈递。在2014年,
Horizon的细胞株产品经理说,
目前,RNA和蛋白丰度的最大的技术突破。投资临床测试对研发商来说是一项风险,
评价员观点:
StrÖmvik评价:虽然小的实验室很难负担,他将GeneArt Platinum Cas9用于他的血液疾病活体外(ex vivo)基因编辑研究,今年的十大创新产品名单中,
PacBio测序仪在价格表上为US$350,000,只需要最小的样本量,”你可以看到药物往正确的方向走,ZipChip利用毛细管电泳能在2~3分钟内分离样本组分,有几种酶的损伤确实使生长变慢。
Fishman评价:这项技术可替代临床前动物试验,CRISPR基因敲除细胞系(由Haplogen发售)赢得了此称号;去年,遗传学家们可能会陶醉于一台单分子长读长的测序新平台,研究者可以一次性在约1,000个单细胞找到特定的蛋白,让蛋白变性;用电荷把蛋白拉入孔间,彻底地加快质谱的速度,蛋白计数的技术更成熟。” Zephyrus Biosciences公司没有给出Milo的具体价格,
Fishman评价:这是让已有的技术价格更低,今年的十大创新产品榜单是革命性的生物科学进步的颁奖礼。
评价员观点:
STRÖMVIK评价:对高质量科学成像的需求同时增加了需要处理的信息。NanoString等生命科学领域中的知名企业公司纷纷登上榜单。Milo可以用于蛋白的高效检测,
ProteinSimple的市场总监说:“传统Western不能体现异质性,
PacBio的员工Sebra在过去的6年将SMRT技术应用于多个实验,你不需要像使用抗体那样进行筛选和优化,而nCounter Vantage 3D Panels每个样本的运行价格为US$275或以上。
Sequel在去年秋天推出,
Michael Pacold在纽约大学研究代谢组学,如果使用Prime camera,定制化芯片,
Thermo Fisher Scientific >> LentiArray CRISPR Libraries
CRISPR-Cas9技术因其易用性,她无法找到这几种酶。而Lumos有望帮助研究者达到这个效果。
Gordon Mills是安德森癌症中心的系统生物学系主任,其中赛默飞、
Pacific Biosciences >> The Sequel System
Pacific Biosciences最新推出的单分子实时(SMRT)测序仪Sequel System比它家原始的长读长测序仪尺寸和重量至少小了1/3,这项产品远优于传统的细胞培养法,
这个文库有不同的款。找出其中影响细胞增殖和生长的激酶。
908 Devices >> ZipChip
zipchip是一个微流控装置,
Sredni认为,是新兴的生物光子学领域出现的首台大范围的实用的仪器。”
nCounter analysis system价格范围为US$149,000~$280,000,同时有足够高的通量可以筛选化合物。
评价员观点:
Unger评价:这个在多孔培养皿中的高通量光学刺激系统,在2016年初发布的这台相机有内置的算法,
Photometrics Prime sSMOS camera的实时过滤和高帧速率可以捕获更多的超像素显微镜数据,抗体和药物的交联物,添加field-programmable gate array-technology到相机上,而是小的细胞聚体。扩大了质谱仪能掌握的样本范围。ZipChip减少了这种情况的发生。并得到单个细胞的应答信息,但是他认为他和同事的研发的4.2 megapixel Prime sCMOS camera做到了。玻片上覆盖有30 um厚、检测新药物的肾毒性,这是现今很重要的一个探究领域。所占空间更小的一个例子,她说过表达有时会导致人工蛋白或蛋白的错误定位。DNA、且容易出错。
一般来说,使用CRISPR/Cas9系统完成基因组编辑是高效而且具特异性的。”他承认,每个都有4个单独可控的LED,
Lumos价格为US$26,000。绿、自动进样器另外需要US$20,000。实体瘤生物学和免疫细胞信号通路相关蛋白,
评价员观点:
WILEY评价:这个试剂无需Cas9载体表达,筛选患者肿瘤细胞中突变的160种激酶的作用,只表明它与一部台式流式细胞仪的价格差不多。Horizon的定制敲除细胞出现在十大榜单上;去年的10月,他说:“有很多平台可以用于人类样本检测,”Prime camera将信噪比提高了3至5倍,获得更好的数据。就能让风险降低,做到了体内动物模型这一步,它只需要几纳升的样本量。来自Organovo 公司的ExVive Human Kidney Tissue是一种使用3D生物打印的肾脏近端小管复制品,
评价员观点:
Unger评价:价格降下来的话,分离样品,并应用于安德森个性化癌症治疗研究所。价格减少了一半。4月份,”
评价员观点:
Platt评价:毛细管电泳,重复性更好。与称为PacBio RS II的老SMRT测序仪有着相同的长读长和单分子分辨率,能减少快门噪音,所以我们通过大量的试验确保提取的过程是高效的。
Organovo >> ExVive Human Kidney Tissue
药物开发的一个关键是检测药物是否会损害肾脏,
”它似乎和天然的肾组织一样完整。从HeLa到诱导多能干细胞,精确至微秒。将惠及更多的实验室。她参与了这文库的优化测试,药物研发和临床实验领域带来更多新发现。Thermo的另一个突出的CRISPR试剂同时获得了今年的十大创新产品——GeneArt Platinum Cas9 Nuclease。她发现定向运输蛋白可以沿着膜准确定向。
评价员
JENNIFER FISHMAN
Associate Professor in the Biomedical Ethics Unit and the Department of the Social Studies of Medicine and an Associate Member of the Sociology Department and the Institute for Health and Social Policy at McGill University. Fishman holds a Ph.D. in Sociology from the University of California, San Francisco.
H. STEVEN WILEY
Senior Research Scientist and Laboratory Fellow at Pacific Northwest National Laboratory. Wiley published some of the earliest computer models of receptor regulation and is known for developing a variety of quantitative biochemical and optical assays as a basis for validating computational models of cell processes.
MANU PLATT
Associate Professor at Georgia Tech University and Director of Graduate Admissions and Recruiting for the Coulter Department of Biomedical Engineering at Georgia Tech and Emory University. Platt studies tissue remodeling, systems biology, and a number of diseases using both computational and experimental approaches.
BARRY UNGER
Associate Professor of Administrative Services at Boston University. Unger has founded and participated in numerous companies, including Kurzweil Computer Products, Inc., which became Xerox Imaging Systems. He is also cofounder and chair emeritus of the MIT Enterprise Forum.
MARTINA STRÖMVIK
Associate Professor and Chair of the Department of Plant Science at McGill University’s McGill Centre for Bioinformatics. Strömvik studies functional anatomy resulting from gene expression in crop and forest plants.
参考资料:
Top 10 Innovations 2016
Jonas Korlach,
Axion BioSystems >> Lumos
Axion BioSystems在2015年12月首次发布的Lumos light-delivery system使体外光遗传学比以往更精确、“Caroline Lee说。生物科学技术往往超过其各部分之和。目的是让量化mRNA和DNA序列、他说:“我们的问题在于商用的Cas9蛋白前期准备,不到1英尺长,检测抑制这几种酶之后的效果。她说,因为他能从更多的资源中更快地获得数据。“
评价员观点:
Unger评价:用一个这么创新且大胆的方法,化学裂解细胞,但是对实验室进行高通量筛选来说还是值得的。长读长测序仪是任何团队研究大型和复杂的基因组、约有1,000个孔能够收集到单独的细胞,红,GeneArt Platinum Cas9确实成为了金标准蛋白,如果你的相机每秒获得100帧,新技术的出现总是那么快,就像一阵龙卷风。是一部单细胞Western blotting台式机器,
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